美国新墨西哥大学医学院生物医学博士,长期从事基因组测序技术开发,拥有近10年基因测序技术及测序仪研发经验。发明了国际领先的单细胞基因组测序技术、双引物悬浊液DPePCR技术、Rolony测序技术以及单倍型基因组测序技术等。作为主要成员参与多款二代测序仪器研发。精通液体样本基因测序、超微量样本的全基因组扩增,对循环肿瘤DNA靶向富集测序等方面研究独到。
2014年,许博士回国创立海普洛斯生物科技有限公司,致力于将最先进的液体样本活检及基因测序技术推广应用于临床,彻底改变现有的肿瘤诊疗模式。许博士曾作为主要成员参与一项美国NIH的270万美金的基因测序技术攻关项目,目前正在主持和参与多项国家省市项目。
曾就职于美国Cambrian Genomics公司,担任二代测序科学家,利用二代测序技术开发出3D DNA激光打印技术,全球第一台能够回收DNA的测序仪。这种技术可以多通道平行合成基因大小的DNA 寡核苷酸,通过低成本、高精度、高通量来实现对合成生物学的革命。
曾作为主要成员参与多款二代测序仪开发,包括Polonator G007(与哈佛大学Church实验室共同开发完成)、Qiagen公司的GeneReader(预计2015年上市)、Cambrian Genomics 的 DNAReader(全球首台能够回收DNA的测序仪)。
【经历】
1、2014年8月至今 海普洛斯?生物科技有限公司CEO及创始人 深圳
2、2013年7月-2014年8月 HaploX 基因组学公司CEO及创始人 美国
3、2013年1月-2014年7月 Cambrian Genomics 公司-科学家 美国
4、2008年8月-2013年7月 新墨西哥大学-研究助理 美国
主要负责完成课题:美国国立卫生研究院资助导师Jeremy S. Edwardsde 项目-“Polony 测序和1000 美元基因组”(270 万美元);
将NGS 应用于胚胎植入前遗传学诊断和筛查(PGD/PGS),肿瘤早期诊断,监测和药物抗性的评估;
开创性地研发了基于单体型的测序技术来直接测量单体型序列;
在PolonatorG.007(与哈佛医学院的George·?M.Church 实验室合作)和MINI-?‐20/GeneReader(Qiagen)开发了Rolony 的连接测序和合成测序技术(SBL 和SBS);
开创性地为Polony 测序技术研发了双引物乳液PCR(DPePCR)技术;
拥有丰富的MiSeq,Nextseq500、Hiseq2000/2500(Illumina 公司),Polonator G.007,Ion Torrent PGM/Proton 和MINI-?‐20/GeneReader二代测序仪经验;
拥有丰富的对不同的二代测序样品制备方法和测序分析的经验。熟悉Boetie/Bowtie2、SAMtools、CLCBio、Golden、Helix 等的开源和商业NGS 数据分析工具。
5、2005年9月-2008年6月 北京师宏药物研制中心-质量监控师 北京
对一系列药物进行质量监控,如[99mTc]‐MIBI,[99mTc]technetepyrophosphate,[99mTc]‐Pentetate,[99mTc]‐MAA 等。
合成超过500 克的Hexakis‐2‐methoxyisobutylisonitrile(MIBI),它可以满足至少10 年中国市场的需求。
拥有丰富的药厂流水线经验,包括有机合成、试剂盒配方的研发、样品消毒配送、冻干、辐射标识、质量控制等。
6、助教
2010 秋季&2012年夏季 微生物实验 生物系,新墨西哥大学
2012 年春季 分子遗传学和基因组学 医学院,新墨西哥大学
2011 年春季 解剖和生理学实验 生物系,新墨西哥大学
【教育背景】
1、生物医学科学博士
2008 年8 月-2013 年7 月,新墨西哥大学,阿尔伯克基,美国新墨西哥;导师:Jeremy S.Edwards;博士论文题目:“二代测序技术的生物医学开发及应用”。曾在新墨西哥大学医学院的分子遗传学和微生物学系Jeremy S.Edwards 教授的实验室工作。研究方向主要集中在应用于生物医学的二代 DNA 测序技术开发。负责完成“Polony 测序及1,000 美元基因组”计划(NIH,270 万美元,3 年),并开发了双引物PCR 乳化技术,Polony测序技术和Rolony(滚环扩增)测序技术。还发明了一种准确,高效的WGA(全基因组扩增)方法用于对单体型的测序。
2、化学硕士
2005 年9 月-2008 年7 月,北京师范大学,北京,中国;导师:唐志刚教授和王学斌教授;合作研发对多种疾病的临床诊断和治疗的放射性药物,如心血管疾病和癌症。通过HPCL 为[99mTc]–MIBI 研发质量控制程序。拥有丰富对动物的实验经验。
3、化学学士
2001 年9 月-2005 年7 月,南昌大学,江西,中国。
【技能】
DNA 测序,单细胞测序,DNA 分析,乳液PCR,DNA 的设计,文库制备,PCR 技术设计,引物设计,Polony 测序,Rolony
测序,单体型测序,跨越多学科领域,如分子遗传学,微生物学,实验室,生物,化学,表面化学,基因组学,遗传学,生物信息学,生物技术,合成生物学,肿瘤生物学,生命科学,分子生物学,制药,动物研究。
【主持、参与项目】
1、2016 年-2020年 国家自然科学基金面上项目,31570861,“基于微流控单细胞芯片的循环肿瘤细胞全基因组测序方法研究”,金额:81万元,参加;
2、2015年 深圳市科创委海归创业项目资助:“基于高通量测序的单细胞分析技术的研发及应用”,金额60万元,主持;
3、2015 年 深圳市南山区自主创新产业发展专项资金资助项目:“新型标志物ctDNA 用于乳腺癌诊疗的技术开发”,金额50万元,主持;
4、2010/08-2013/06 美国NHGRI项目R21HG004350/564251“Polony Sequencing and the $1000 Genome”,270 万美元,已结题,参与。
【专利、出版物、会议】
1、一种基于MDA的全基因组扩增的方法(201410709576.5),发明人:许明炎;
2、一种PCR引物及其修饰方法及基于平行高通量单分子高保真的扩增方法(201410709579.9),发明人:许明炎;
3、一种富集循环肿瘤DNA的方法和试剂(PCT/CN2015/070188),发明人:许明炎、张晓妮;
4、Mingyan Xu, Anthony D. Aragon, Norah Torrez-?‐Martinez, and Jeremy S. Edwards, Haplotype?‐ resolved sequencing,in manuscript.
5、Mingyan Xu, Anthony D. Aragon, Norah Torrez?‐Martinez, and Jeremy S. Edwards, Rolony sequencing technology for next- generation sequencing, submitted.
6、Mingyan XU, Anthony D. Aragon, Norah Torrez-?‐Martinez, and Jeremy S. Edwards, DPePCR: A Novel Technique for DNA Sequencing, BioTechniques: 10-?‐12(Protocol Guide 2011) doi: 10.2144/000113542.
7、Mingyan Xu, Anthony D.Aragon, Monica R. Mascarenas, Norah Torrez?‐Martinez, and Jeremy S. Edwards, Dual Primer Emulsion PCR for Next-?‐Generation DNA Sequencing, BioTechniques 48:409-?‐412 (May 2010) Doi10.2144/000113423.
8、Mingyan Xu, Jeremy S. Edwards, Chapter 5, DNA Sequencing features. In manuscript.
9、Mingyan Xu*, C. Hazel Higgins *, Antoine Ho, Priyanka Rawat, Anthony Aragon, Norah Torrez?‐ Martinez, Jeremy S.Edwards, Development and application of innovative, robust, high-?‐ throughput nanotechnologies, NHGRI DNA Sequencing Technology Development Grantee Meeting, San Diego, CA. April 2012 poster presentation.
10、Mingyan Xu, Antoine Ho, Anthony Aragon, Norah Torrez-?‐Martinez, Jeremy S. Edwards, Polony Sequencing Rolling Circle
Amplicons, NHGRI DNA Sequencing Technology Development Grantee Meeting, San Diego, CA. April 2011 poster presentation.
11、Jeremy Edwards, Mingyan Xu, Polony Sequencing and the $1,000 Human Genome, The 38th Federation of Analytical Chemistry and Spectroscopy Societies conference, Reno, NV. October 27, 2011.
12、Jie Lu, Mingyan Xu, Hongmei Jia, Shuxia Xi, Yimeng wang, Xuebin Wang,Synthesi and
biodistribution of novel 99mTc-?‐nitrido methylpiperidine dithioformate derivatives as potential brain imaging agents, Journal of Labeled Compounds and Radiopharmaceuticals, Volume 52, Issue 6, pages 183–188, 30 May 2009 DOI: 10.1002/jlcr.1587.
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